Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHST12Q9NRB3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST12Q9NRB3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms