Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF3Q9NR23 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms