Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BIN3Q9NQY0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms