Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms