Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM5Q9NQX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM5Q9NQX1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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