Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRD1BQ9NQG5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRD1BQ9NQG5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms