Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCUBE2Q9NQ36 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCUBE2Q9NQ36 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCUBE2Q9NQ36 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms