Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCRT2Q9NQ03 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms