Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FZD3Q9NPG1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FZD3Q9NPG1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms