Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPHS2Q9NP85 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms