Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PLXNA4Q9HCM2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXNA4Q9HCM2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms