Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms