Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX8Q9HC52 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms