Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00574Q9H8X3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00574Q9H8X3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms