Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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