Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSS3Q9H6R3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSS3Q9H6R3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSS3Q9H6R3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSS3Q9H6R3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSS3Q9H6R3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSS3Q9H6R3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSS3Q9H6R3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms