Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC4Q9H6D8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms