Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms