Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCAD1Q9H4L7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms