Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMOC1Q9H4F8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOC1Q9H4F8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms