Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms