Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A8Q9C0K1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A8Q9C0K1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms