Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRCC1Q9C099 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRCC1Q9C099 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRCC1Q9C099 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRCC1Q9C099 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRCC1Q9C099 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRCC1Q9C099 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRCC1Q9C099 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRCC1Q9C099 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms