Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXQ1Q9C009 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms