Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUS3Q9BZE2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUS3Q9BZE2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms