Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCO2Q9BYV7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms