Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3CQ9BXW4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms