Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD1Q9BXT4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms