Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRIP1Q9BX63 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms