Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP85Q9BW27 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms