Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIOK2Q9BVS4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIOK2Q9BVS4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms