Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM62Q9BVG3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms