Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf50Q9BV19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf50Q9BV19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms