Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM175Q9BSA9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms