Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP19Q99542 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms