Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms