Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN18Q96SJ8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms