Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALS2CR12Q96Q35 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CR12Q96Q35 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms