Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNT1Q96Q11 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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