Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCEEQ96PE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms