Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN4Q96NY8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN4Q96NY8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms