Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC6Q96NY7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC6Q96NY7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms