Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC115Q96NT0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC115Q96NT0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms