Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RIPOR3Q96MK2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms