Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74BQ96LY2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC74BQ96LY2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms