Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC17Q96LX7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms