Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD1Q96JS3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD1Q96JS3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD1Q96JS3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms