Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC22AQ96IW7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22AQ96IW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms