Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms