Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms