Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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